GeneChip Mouse Exon 1.0ST Array 小鼠外显子芯片
小鼠全转录本表达谱芯片，约有4个探针来针对每个外显子 / 约有40个探针来针对每个基因，覆盖经验性及预测的外显子序列，约1000000个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。
细胞周期甲基化qPCR芯片(Cell Cycle EpiTect Methyl qPCR Array)
细胞周期甲基化PCR芯片用于研究参与细胞周期调控的22个关键基因的启动子甲基化状态。利用这个芯片分析细胞或新鲜组织基因组DNA样本可能有助于关联CpG岛甲基化状态与生物表型。
Affymetrix Plasmodium/Anopheles Genome Array 疟原虫
该芯片包括约4,300 Plasmodium falciparum 的转录子和约14,900 Anopheles gambiae 转录子。
肿瘤转移基因表达PCR芯片
肿瘤转移PCRArray可以同时检测已知的参与肿瘤转移的84个基因的表达。芯片所选的基因编码以下几类蛋白因子：细胞黏附、ECM成分、细胞周期、细胞生长和增殖、凋亡、转录因子和调节子以及其他一些转移相关因子。